Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms