Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc69Q3TCJ8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms