Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prr27Q3SYJ2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms