Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col24a1Q30D77 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms