Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms