Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Edem3Q2HXL6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms