Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Shroom4Q1W617 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Shroom4Q1W617 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Shroom4Q1W617 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Shroom4Q1W617 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Shroom4Q1W617 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms