Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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