Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpusd3Q14AI6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd3Q14AI6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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