Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp2b3Q0VF55 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms