Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc1Q0VDN7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms