Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbp2Q08652 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms