Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MestQ07646 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MestQ07646 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms