Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms