Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cab39Q06138 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms