Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox12Q04890 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms