Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai1Q02085 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms