Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gja5Q01231 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms