Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PrcdQ00LT2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms