Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoa1Q00623 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms