Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pitx2P97474 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms