Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nbr1P97432 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nbr1P97432 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms