Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms