Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx1P80205 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms