Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad50P70388 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms