Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
UbdP63072 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms