Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rps28P62858 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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