Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps11P62281 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms