Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lmo4P61969 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lmo4P61969 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lmo4P61969 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lmo4P61969 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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