Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snap25P60879 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms