Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps5P59438 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps5P59438 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps5P59438 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hps5P59438 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps5P59438 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hps5P59438 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms