Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrnp3P59055 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms