Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms