Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P58686 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P58686 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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P58686 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P58686 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms