Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Setd4P58467 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Setd4P58467 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Setd4P58467 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms