Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SmoP56726 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SmoP56726 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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