Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp5P56399 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms