Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CartptP56388 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CartptP56388 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CartptP56388 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms