Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms