Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dbx1P52950 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dbx1P52950 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms