Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnt2P50752 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms