Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SftpbP50405 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SftpbP50405 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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