Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms