Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PtpreP49446 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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