Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc3P49135 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms