Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox8bP48772 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms