Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VdrP48281 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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VdrP48281 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VdrP48281 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
VdrP48281 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VdrP48281 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VdrP48281 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VdrP48281 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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