Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms