Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Syt1P46096 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syt1P46096 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms