Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Mmp9P41245 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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